Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms