Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RubcnlQ3TD16 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms