Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Treml4Q3LRV9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Treml4Q3LRV9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Treml4Q3LRV9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Treml4Q3LRV9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Treml4Q3LRV9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Treml4Q3LRV9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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