Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cpne9Q1RLL3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cpne9Q1RLL3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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