Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp8b1Q148W0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp8b1Q148W0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp8b1Q148W0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atp8b1Q148W0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atp8b1Q148W0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms