Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ttc39dQ0VF76 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc39dQ0VF76 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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