Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rundc1Q0VDN7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms