Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms