Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms