Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Tff1Q08423 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tff1Q08423 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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