Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cntn3Q07409 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Cntn3Q07409 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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