Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms