Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Thbs2Q03350 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms