Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms