Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms