Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ascl1Q02067 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ascl1Q02067 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms