Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mc1rQ01727 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms