Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top2aQ01320 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Top2aQ01320 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms