Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EgfrQ01279 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms