Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms