Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms