Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gfra1P97785 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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