Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smarcc1P97496 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms