Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkp1P97350 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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