Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cbx1P83917 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cbx1P83917 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms