Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms