Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tp53bp1P70399 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tp53bp1P70399 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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