Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfybP63139 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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NfybP63139 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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NfybP63139 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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NfybP63139 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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NfybP63139 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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NfybP63139 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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NfybP63139 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NfybP63139 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms