Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rps28P62858 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms