Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rps29P62274 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Rps29P62274 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rps29P62274 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms