Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rin3P59729 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms