Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CgnP59242 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CgnP59242 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CgnP59242 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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