Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp1P59054 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms