Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm2P58774 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tpm2P58774 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tpm2P58774 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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