Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atp5bP56480 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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