Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp5P56399 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp5P56399 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp5P56399 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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