Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms