Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa6P50704 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa6P50704 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms