Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TspoP50637 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TspoP50637 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms