Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ItgavP43406 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms