Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tnfsf9P41274 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tnfsf9P41274 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tnfsf9P41274 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tnfsf9P41274 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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