Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Mmp9P41245 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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