Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tjp1P39447 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms