Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp4P35123 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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