Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms