Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RxraP28700 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RxraP28700 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RxraP28700 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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