Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vav1P27870 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms