Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NdnP25233 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NdnP25233 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms