Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZfaP23607 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZfaP23607 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZfaP23607 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms