Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms